گروه بندی ژنتیکی تعدادی سویه ریزوبیومی بومی خاکهای ایران با استفاده از تکنیکهای S-۲۳S IGS PCR-RFLP۱۶ و پروفیل پلاسمیدی

در بین پروکاریوتها مجموعه ای از باکتریهای خاکزی که اصطلاحا ریزوبیا نامیده می شوند به لحاظ توانایی در ایجاد سیستم همزیستی تثبیت کننده نیتروژن مولکولی با گیاهان خانواده لگوم حائز اهمیت فراوانی هستند. توالی بین ژنهایrRNA ۱۶S و rRNA ۲۳S که اصطلاحا ۱۶S-۲۳S IGS نامیده می شود از نظر اندازه و توالی بسیار متفاوت بوده و ابزار مفیدی برای گروه بندی سویه های ریزوبیومی می باشد. در این مطالعه تعداد ۵۲ سویه برتر ریزوبیومی که بعنوان عوامل محرک رشد گیاه (PGPR) شناخته شده اند، بطریق۱۶S-۲۳S IGS PCR-RFLP و پروفیل‎ پلاسمیدی‎) روش اکهارت) گروه بندی شد. نتایج حاصل نشان می دهد که IGS سویه های ریزوبیومی مورد مطالعه از نظر اندازه بسیار متنوع (bp ۱۴۸۶-۶۰۰) است. بعلاوه تعداد نسخه های IGS سویه های مختلف نیز یکسان نبوده و از یک تا سه نسخه متفاوت می باشد.
بر اساس روش مجموع ۵۲ سویه ریزوبیومی در ۴۶ گروه مختلف قرار گرفت که افراد ۱۱ گروه دارای ۷۰ درصد تشابه بین سویه ای هستند. با استفاده از این روش بجز ۱۲ سویه‎ی‎ ۵۴ Bj و Bj ۵۳ ، ۲۸ Rlv و ۲۷ Rlv ،۲۴ Rlvو ۲۳ Rlv ، ۱۷ Rlp و ۱۶ Rlp، ۱۳ Sm و ۱۲ Sm و۱۱ Sm و ۱۰ Sm، مابقی سویه ها (۷۷ درصد) کاملا از یکدیگر تفکیک شد. بنابراین روش مذکور بدلیل ساد‎گی و نیازهای اندک آزمایشگاهی (نسبت به سایر روشهای مولکولی) براحتی قابل انجام بوده و از کارآمدی و اطمینان بالایی نیز برخوردار است. گروه بندی مبتنی بر پروفیل پلاسمیدی سویه های مختلف ریزوبیومی مورد استفاده در این تحقیق تا حدودی با نتایج حاصل از روش IGS PCR-RFLP هماهنگی دارد، بطور مثال سویه های۵۴ Bj و۵۳ Bj ، سویه های ۲۴ Rlv و ۲۳ Rlv، همچنین سویه های ۱۷ Rlp و ۱۶ Rlp و سویه های ۱۳ Sm و۱۲ Sm و ۱۱ Smدر هر دو روش بصورت کاملا مشابه در کنار یکدیگر و درون گروههای کلاستری جداگانه قرار گرفتند.

حسین‌علی علی‌خانی
باقر یخچالی
هانی آنتون

منبع : پایگاه اطلاعات علمی